Persistant molecule name in MSketch loaded with SetMol

Hi,

I load a molecule in a MSketch applet using the MSketch.setMol() function; my molecule is in MDL's MOL format, and the first line contains the molecule name.

After modifying the molecule in the MSketch applet, a call to the function MSketch.getMol("mol")
gives me the correct modified structure, however the first line of the
MOL string still contains the original molecule name as defined in my
input MOL file.

The question: is there a way to change or clear the molecule name property? I tried to read the mol properties using MSketch.getMolPropertyCount(), MSketch.getMolPropertyKey() and MSketch.getMolProperty(), but no information are stored there.

Thanks a lot for your answer!

Grégori

 

Here is an example of a molecule that triggers the observed issue (and see the attached image for the result after modifying the molecule):

caffeine
   smi2mol          2D

 14 15  0  0  0  0  0  0  0  0999 V2000
    2.3779    2.5747    0.0000 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
    1.6199    3.2572    0.0000 N   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
    1.7247    4.2516    0.0000 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
    0.8112    4.6583    0.0000 N   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
    0.1420    3.9152    0.0000 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   -0.8580    3.9152    0.0000 N   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   -1.3680    4.7985    0.0000 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   -1.3579    3.0494    0.0000 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   -2.3779    3.0494    0.0000 O   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   -0.8580    2.1833    0.0000 N   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   -1.3678    1.3000    0.0000 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
    0.1419    2.1833    0.0000 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
    0.6521    1.3000    0.0000 O   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
    0.6418    3.0492    0.0000 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
  1  2  1  0  0  0  0
  2  3  1  0  0  0  0
  2 14  1  0  0  0  0
  3  4  2  0  0  0  0
  4  5  1  0  0  0  0
  5  6  1  0  0  0  0
  5 14  2  0  0  0  0
  6  7  1  0  0  0  0
  6  8  1  0  0  0  0
  8  9  2  0  0  0  0
  8 10  1  0  0  0  0
 10 11  1  0  0  0  0
 10 12  1  0  0  0  0
 12 13  2  0  0  0  0
 12 14  1  0  0  0  0
M  END

Here a more obvious example of the problem:

The only way to modify molecule name is edit it directly in the molecule source.

If you work in sketcher, you can do it by the following way:

1. Open Edit/Source window.


2. Modify name in MDL molfile format


3. Import modified structure