Molconvert, write additional informations from sdf to SMILE

Hello,

i want to convert an SDF file with additional descriptions to an smile file. The output should be like this:

 

Input SDF:

 

  Mrv1539 04231510203D          

  4  3  0  0  0  0            999 V2000
    0.6038   -1.1459    0.0350 C   0  0  1  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   -0.0770    0.1013   -0.3457 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   -0.4348    0.9252    0.5261 O   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   -0.3617    0.4781   -1.9693 Cl  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
  1  5  1  0  0  0  0
  1  6  1  0  0  0  0
  1  7  1  0  0  0  0
M  END
>  <chem>
CHLOROACETYL CHLORIDE

>  <HBD>
0.0

>  <HBA1>
1.0

>  <HBA2>
1.0

>  <molwt>
112.94268

>  <RotBonds>
1

>  <TPSA>
17.07

>  <logP>
0.9906

>  <bonds>
4.0

>  <sbonds>
3.0

>  <atoms>
5.0

>  <MR>
21.52

>  <abonds>
0.0

>  <toxClass>
class2

>  <doseLD50>
32

$$$$

Output:

#SMILES    chem    HBD    HBA1    HBA2    molwt    RotBonds    TPSA    logP    bonds    sbonds    atoms    MR    abonds    toxClass    doseLD50
Cc1cccc(c1Br)C    BENZENE, 2-BROMO-1,3-DIMETHYL-    0.0    0.0    0.0    185.06106    0    0.0    3.0659    9.0    3.0    9.0    44.074    6.0    class3    56

i just copy pasted some random values, so dont wonder if values in the input and output arent the same.

is this possible?

I would be very grateful for your help.

Try this command:

 molconvert smiles:T* -o output.smi input.sdf

You can export every property with the T* option. For the description of the possible SMILES export options, you can also see this page: https://docs.chemaxon.com/display/FF/SMILES+and+SMARTS+import+and+export+options

Thank you!!!